Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms