Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms