Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAE1P78406 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAE1P78406 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAE1P78406 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms