Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms