Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HBBP68871 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HBBP68871 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HBBP68871 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms