Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms