Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA4AP68366 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms