Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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