Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms