Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms