Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms