Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CX3CR1P49238 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms