Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A3P48751 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms