Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms