Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR4A2P43354 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms