Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms