Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT4P35916 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT4P35916 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT4P35916 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT4P35916 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT4P35916 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT4P35916 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT4P35916 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT4P35916 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLT4P35916 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLT4P35916 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms