Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA4P35212 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA4P35212 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA4P35212 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA4P35212 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms