Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms