Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMBRP28336 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms