Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms