Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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