Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD247P20963 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms