Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms