Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD53P19397 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD53P19397 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD53P19397 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms