Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRAP18433 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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