Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN1P18031 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms