Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA2P17301 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms