Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM27P14373 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms