Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODC1P11926 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODC1P11926 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms