Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2AP11388 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2AP11388 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2AP11388 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2AP11388 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2AP11388 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2AP11388 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2AP11388 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms