Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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