Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK1P06493 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK1P06493 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms