Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms