Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms