Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms