Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms