Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms