Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NDUFS4O43181 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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