Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms