Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms