Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms