Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WIPF3A6NGB9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WIPF3A6NGB9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms