Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms