Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TARSL2A2RTX5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms