Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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