Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms