Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms