Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A8Q9Y2E8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A8Q9Y2E8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A8Q9Y2E8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms