Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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